Buhenwald var også et åsted for et storstilt eksperiment for mulig vaksine mot tyfus i 1942 og 1943. I alt ble 729 fanger berørt av dette, ca 280 av disse døde. På grunn av at så mange fanger var sperret inne i Block 46, døde flere på grunn av bakterier og infeksjoner, og tyfus-epidemier var vanlige.